消化性溃疡的主要症状以上腹部疼痛为主。这种疼痛的部位多位于上腹中部偏右或偏左，但是因为空腔内脏的疼痛在体表上的定位不够确切，所以疼痛的部位也不一定能准确的反应溃疡所在的解剖位置。

疼痛的性质一般是可以表现为隐痛、钝痛、胀痛、烧灼样痛或者饥饿样的不适感。另外，节律性的疼痛是消化性溃疡的特征表现之一，与进食有关。比如十二指肠溃疡的疼痛常在两餐之间，或者餐前发生，进食或者服用抗酸剂后可缓解。胃溃疡的疼痛，多在餐后的一小时内出现，经过一到2个小时逐渐缓解，一直到下次进餐之后再复发上述的节律。

还有一个消化性溃疡疼痛的又一特征，就是周期性的疼痛。比如上腹痛发作，可持续数天、数周或者数月，然后较长时间的缓解，然后再复发，这种节律性的疼痛也是它的特征之一。