导致长期排尿困难的原因不同，处理方法也不一样。

如果是前列腺增生所导致的排尿困难，可以先进行药物治疗，比如非那雄胺、坦索罗辛等，使腺体缩小，改善排尿困难的症状。如果排尿困难持续加重，反复出现尿潴留，应考虑进行手术治疗，比如经尿道前列腺电切术。

如果是尿道狭窄所引起的排尿困难，在必要时应进行尿道扩张术。如果长期排尿困难为泌尿系统肿瘤所引起，比如尿道肿瘤、膀胱肿瘤等，在完全确诊以后，应尽早地进行手术切除，手术后需要辅助以放、化疗治疗。