脑血栓可引起昏迷和呼吸衰竭，尤其是大面积脑梗死。一旦患者发病，可能导致昏迷，甚至严重呼吸衰竭和呼吸停止，需要紧急气管内插管和呼吸机辅助呼吸。

由于肢体功能不全，脑梗死患者长期卧床时，可能患上肺炎。有些病人可能因吞咽功能受损而出现呛咳和误吸，导致吸入性肺炎，这些肺部感染会导致呼吸衰竭，导致低氧血症。

另外，如果脑梗死的部位在脑干，脑干梗死患者，会导致昏迷和中枢性呼吸衰竭，要积极的进行治疗。