软骨母细胞瘤与骨母细胞瘤可以通过三种方法进行鉴别：

首先，肿瘤的临床表现，软骨母细胞瘤主要发生在长骨的骨垢部位；而骨母细胞瘤主要侵犯患者的尾椎骨和长骨，临床表现有一定的差异。

其次，根据影像学进行鉴别，软骨母细胞瘤与骨母细胞瘤在结构上也有一定的差别。

第三，进行病理学的检查。有时通过临床表现和影像学无法进行明确的鉴别，可以对病变组织进行病理学的检查，能够对患者的病情进行明确的诊断。