针灸治疗先天性心脏病的效果不是很明显，目前治疗方法有手术治疗、介入治疗和药物治疗等。

对于主动脉瓣狭窄、肺动脉瓣狭窄、主动脉缩窄等，可以使用球囊扩张。对于如房间隔缺损、室间隔缺损、动脉导管未闭等，可以利用各种记忆金属材质，一些特殊材料封堵器，堵闭不应有的缺损。

对于目前尚无根治方法的复杂先心病，可以使用肺动脉下心室旷置术等姑息手术。对于终末性心脏病，无法用目前的手术方法治疗的复杂先心病，可以考虑心脏移植。对于缺损直径小，对血流动力学无明显影响的，可不需要特殊治疗。