小儿秋季腹泻最常见的疾病为轮状病毒肠炎，此病潜伏期1~3天，常伴发热及上呼吸道感染症状。病初容易呕吐、大便次数多、量多、水分多，以黄色水样或蛋花样便为主，无腥臭味。大便检查偶见少量的白细胞，易伴发脱水、酸中毒及电解质紊乱。病程为3~8天，为自限性疾病，通过对症治疗可治愈。

夏季腹泻多为细菌感染性腹泻，一般发热症状较重。大便呈现黏液脓血便为主，常伴有恶心、呕吐，及里急后重感，可并发败血症及感染中毒性休克。