新型冠状病毒核酸检测最常用的是荧光定量聚合酶链式反应，也就是PCR。

新型冠状病毒PCR检测，先将新型冠状病毒RNA逆转录为DNA，再进行DNA的扩增，随着反应产物不断累积，荧光信号强度等比例增加。最后通过荧光强度变化监测扩增产物量的变化，从而判断新型冠状病毒是阳性还是阴性，是阳性病毒量的多与少。

其他新型冠状病毒核酸检测的方法，还有联合探针锚定聚合测序法、恒温扩增芯片法以及胶体金等方法。