色甘酸钠眼药水属于肥大细胞膜稳定剂，通过阻断过敏介质和炎症介质的释放，而起到抗炎、抗过敏作用。

主要用于控制速发型变态反应，预防和控制过敏性角结膜炎。常用的浓度是2%到4%的色甘酸钠滴眼液。局部应用后，可能出现烧灼感、眼睑水肿、刺痒等不良反应。由于色甘酸钠眼药水起效比较慢，常用于预防过敏性炎症反应。

临床上多用于在过敏性季节提前一到两周使用色甘酸钠眼药水滴眼，预防过敏性结膜炎的发作。而迅速缓解症状可用肥大细胞膜稳定剂及抗组胺药合剂，以及激素类眼药水。