新生儿疱疹和湿疹的区别主要概括如下：

1.两者病因不同。对于疱疹主要是因病毒感染而造成的，而对于新生儿湿疹多数是因为孩子本身是过敏体质或接触了致敏原等引起的过敏反应，属于过敏性疾病。

2.引起的症状不同。疱疹一般在发作时会使患儿出现发烧或头痛、全身不适，有的还会出现大脓包。而对于湿疹通常会使患儿局部皮肤出现对称性红斑或丘疹、疱疹、水疱等，多伴随阵发性剧烈瘙痒，会使孩子哭闹不止、睡眠不安。