脑炎引起下半身瘫痪，应该积极地进行传染科以及配合神经内科的治疗。一方面是针对脑炎的治疗，如合理地使用抗感染的药物、对症处理、营养支持、维持身体的水电平衡等治疗措施。

另一方面应该是进行神经内科的针对下肢瘫痪的治疗，如合理地使用营养神经的药物、对症处理等。当病情稳定，患者的脑炎得到控制，患者的病情进入康复期的时候，应该进行康复科的康复训练，如进行下肢的被动运动。

当患者能够走路的时候，应该让患者进行主动的康复训练以及配合患者的针灸、按摩、中医中药的调理等。通过综合的治疗措施，让患者的下半身得到有效地恢复。