脑干梗塞用磁共振是能检查到。磁共振对中枢神经系统的检测有较为明显的优势。

脑干梗塞表现为，在脑干上T1WI低信号，T2WI及FLAIR 序列呈现高信号的影像表现。当梗死发生在超早期，还可以通过扩散加权成像，即DWI序列看到高信号。用来超早期发现脑梗塞，便于后续的溶栓等治疗。

针对脑梗塞而言，整体效果要优于CT检查，是目前应用较为广泛的针对脑梗塞检查的一种方式。