毛囊虫病出现之后，可以引发很多种并发症。可以引发酒渣鼻样皮炎，这种情况会由于毛囊虫堵塞毛孔，再加上日常生活中，吃刺激性的食物和过度饮酒而导致症状发作，引起局部出现瘙痒、丘疹等改变。

除此之外，还会引发毛囊虫性痤疮。这种情况是因为毛囊虫堵塞以后，使毛孔内部处于缺氧的状态，滋生了大量的厌氧菌而形成的痤疮样改变。

还会由于毛囊虫病而并发眼睑出现一些炎症，称之为睑缘炎。民间俗称为烂眼边，会导致眼睛周围出现疼痛，甚至会引发明显的分泌物和瘙痒等症状。