总体来说，乙型肝炎病毒性相关关肾炎的治疗原则是，降低蛋白尿、防止疾病的复发、保护肾功能和延缓肾脏疾病的进展。具体来说由于乙型肝炎病毒相关性肾炎为乙型肝炎所致，因此有乙型肝炎病毒复制的证据时，应该要积极的抗病毒治疗。目前常用的治疗药物包括有干扰素、拉米夫定和恩替卡韦。如果乙型肝炎病毒复制转阴以后，部分乙型肝炎病毒性相关性肾炎患者尿蛋白也可以减轻甚至会消失。当然，也可以使用糖皮质激素联合免疫抑制剂治疗，乙型肝炎病毒性相关性肾炎在减少蛋白尿可以起到短期的效果，但多数效果不明显。而免疫抑制剂治疗可以延迟乙型肝炎中和抗体产生，促进乙型肝炎DNA复制而加重病情。只有在严重低蛋白血症和大量蛋白尿时，且病毒复制指标阴性的情况下才可以应用。当然，在用药期间需要检测乙型肝炎病毒复制指标。