肺癌靶向药物的副作用，由于应用药物种类不同，副作用的类型存在区别。

第一大类的靶向药物，是酪氨酸激酶抑制剂。其主要的副作用表现在皮肤的皮疹副作用，或者胃肠道腹泻的副作用。有些患者会出现肝脏功能损伤，表现为谷丙谷草转氨酶指标异常升高，有的会出现轻度骨髓抑制副作用。

另一大类靶向药物，是抑制血管生成的药物。这类药物主要的副作用，包括蛋白尿、高血压、出血、心脏功能障碍等。