同房的时候阴道疼痛主要原因有以下几点：

1.可能跟性生活次数有关，如果过于频繁的进行性生活，或者性生活时由于激烈，都有可能会导致阴道损伤，出现阴道疼痛症状。

2.可能跟阴道炎有关，当出现阴道炎后会产生比较明显的阴道充血、水肿，分泌物增多后也有可能会出现疼痛症状。

3.还有可能跟其他疾病有关，比如出现宫颈癌等各种恶性肿瘤性疾病后，也有可能会出现阴道疼痛症状。建议及时去医院进行具体检查，判断有无出现恶性病变。