类百日咳和百日咳的症状非常相似，两者从症状上是无法进行鉴别的。两者的区别主要是引起的病原体不同。

百日咳是由百日咳杆菌引起的。类百日咳不是由百日咳杆菌所引起，而是由包括病毒在内的其他微生物所致，其中最常见的是腺病毒，其他还有肺炎支原体、呼吸道合胞病毒、巨细胞病毒等。

百日咳和类百日咳都可以分为三个时期，包括卡他期、痉咳期和恢复期。类百日咳综合症痉咳期导致的面部眼睑浮肿、眼结膜出血、鼻出血等症状通常较百日咳会相对轻一些。两者的鉴别主要是要通过实验室检查，分离出不同的病原体。