无菌性的前列腺炎，其发病机制比较复杂，可能仍然与某些病原体有关，所以其治疗可以经验应用抗生素治疗。

前列腺炎一般会影响排尿的症状，可以用阿尔法受体阻滞剂及m受体阻滞剂来改善排尿的症状。对于前列腺炎长期存在的患者，可以并发骨盆区疼痛综合症，所以可以应用非甾体止痛药物治疗。

一些患者因排尿异常症状或疼痛持续存在，导致出现焦虑抑郁等精神疾病，此时可以应用抗焦虑抗抑郁的药物。对于因自身免疫导致的前列腺炎，可以应用免疫抑制剂治疗。