滴虫性龟头炎和念珠菌龟头炎两者的区别主要在于致病原因不同，滴虫性龟头炎是由于阴道毛滴虫感染龟头而引起龟头炎。念珠菌龟头炎是由于真菌感染龟头，导致真菌性龟头炎。

滴虫性和念珠菌龟头炎两者的症状表现大致相同，早期龟头会出现红肿、瘙痒等，局部可伴有分泌物增多、糜烂、溃疡等。

在治疗方法上，念珠菌龟头炎的治疗主要使用抗真菌药物，而滴虫性的龟头炎，主要使用甲硝唑一类的药物治疗。