大部分的新型冠状病毒肺炎患者预后良好，治愈后不会留下什么后遗症。对于一些老年有基础疾病的患者，发作为重症或者危重症的新型冠状病毒肺炎，出现了呼衰、感染性休克或者多脏器功能的衰竭，那么严重的情况下会导致死亡，即使没有死亡抢救以后由于缺氧或者脏器功能衰竭会留下并发症后遗症。

常见的后遗症大多数是由于呼吸衰竭、缺氧导致的，如果早期治疗纠正可以没有后遗症。如果长时间的缺氧会造成心功能，肝肾功能以及脑功能不可逆的损伤，出现一些慢性的脏器功能不全。