肛周脓肿保守治疗主要是使用抗生素。因为肛周脓肿是肛管直肠周围的化脓感染性疾病，所以肛周脓肿最关键的是抗感染治疗。

由于肛周脓肿大多为混合性感染，所以需要使用广谱抗生素。对于局部感染以及临床症状偏轻的患者，可以使用一种广谱抗生素抗炎治疗。而对于感染范围偏大，临床症状明显的患者，需要联合使用抗生素以加强抗炎治疗的效果。

在抗炎治疗的同时，患者也可以配合局部使用药物缓解局部的肿痛症状，例如可以使用一些消肿、止痛的中药坐浴或者外用消肿止痛的痔疮膏。对于肛周脓肿已经形成明显的脓腔，或者经保守治疗效果欠佳，应及时行手术治疗。