肛裂在临床上一般采取非手术综合治疗以及手术治疗两种。

非手术综合治疗只适用于新鲜肛裂或者作为手术治疗的辅助疗法，常用的是温盐水坐浴，以清洁创面消除水肿，促进局部血液循环，可以外敷药膏，促进创面愈合。也可以用封闭或者局部注射法，以达到止痛目的，解除肛门括约肌痉挛。

手术治疗适合于陈旧性肛裂，采取的手术方式多为内括约肌部分肌纤维切断术、肛裂切除皮瓣移植术、切开法以及扩肛纵切缝合法。