肛门处长了一个肉疙瘩很痛，可能是以下原因所造成的：

1.血栓性外痔会在肛门外形成一个肉疙瘩，形状呈半球形或者椭圆形，触摸比较硬，疼痛明显，还有可能会引发便血的现象。

2.内痔脱出肛门，也会形成肉疙瘩的现象。当发生充血、水肿时会导致疼痛加剧，肛门坠胀等不适感。

3.肛乳头瘤脱出肛门时，也会形成一个肉疙瘩，比较疼痛，特别是排便时会有加重疼痛的现象。

4.肛门息肉脱出肛门从而造成局部充血、水肿，引发感染，也可以出现疼痛的现象。还有其他原因所导致，建议就诊后再给予治疗。