甲型流感发病期间有可能会引发脑炎等并发症。甲型流感是由流感病毒感染引发的一种上呼吸道感染性疾病，发病期间由于人体免疫力下降，如果病情得不到有效控制，病毒细菌等病原体可能会通过血脑屏障进入到颅内引发脑炎、脑膜炎等颅内感染性疾病。

患者发病期间，如果出现反复高热、剧烈头痛、喷射性呕吐甚至出现意识障碍等临床症状时，考虑存在颅内感染性疾病的可能性较大。

建议及时去医院神经内科进行血常规、C反应蛋白、脑电图以及脑部CT等相关检查，确诊后按医嘱治疗。