新生儿心肌酶高可通过以下几种方式治疗：

1.可以采取保守治疗的方式，可以服用促进身体循环和身体代谢的药物。

2.平时可以适当锻炼，提高身体体质，但活动的量不能太大，活动量大会加重心脏负担，从而不利于心肌酶恢复。

3.平时要注意房间内的通风换气，预防病菌，自身做好防寒保暖的工作，避免加重病情，平时要减少室内的刺激性气味，多喝水促进新陈代谢。

4.进一步在医院检查确认心肌酶增高的原因，对症下药，不可盲目吃药。