轻微的输精管堵塞令女性的怀孕几率不大，甚至会令女性完全不能够怀孕，因此，输精管堵塞的男性应当及时治疗。

炎症感染所引发的输精管堵塞，先进行抗感染，如果治疗效果不佳，可考虑进行手术疏通。如果为囊肿或者肿瘤压迫所引起，要将囊肿或肿瘤进行切除，输精管会通畅。如果为结核疾病所引起，应当选用抗结核药物，必要时也可考虑手术疗法。

有部分先天性输精管堵塞患者，在手术后可能无法疏通，如果想要生育，可考虑其他生育方式，比如试管婴儿、人工受精等。