骨不连两年以上会造成局部的疼痛。

畸形活动障碍，肌肉萎缩，可以形成局部的神经瘤，造成长期慢性的疼痛。并且长期的骨不连可以造成局部断端的硬化，有可能会因细菌侵袭造成感染和骨髓炎的情况。这种情况骨不连时间比较久，局部供血差，断端逐渐硬化。因为影响局部的功能和活动，所以会造成局部肌肉萎缩。并且骨折没有愈合，局部的肌肉血管也处于粘连僵硬的状态，不能得到正常的活动和锻炼。容易出现局部肌肉神经功能降低，严重时可以引起变性。

所以需要注意，一旦有这种情况可以进行手术治疗，进行切开植骨，尽快恢复肢体的连续和局部的功能。