勃起时睾丸会疼痛，可能的原因如下：

1.长时间性刺激导致勃起以后，会出现附睾瘀滞的现象，也就是睾丸产生的精子存储在附睾之内，没有发生射精的情况就会出现睾丸胀痛。这种情况通常射精以后会好转，属于一种生理性的现象，也并非疾病的情况。

2.可能有慢性附睾炎或者睾丸炎，在长时间勃起以后，加重局部的充血瘀血，这时就会产生疼痛感。

3.有可能是睾丸存在其他的疾病，比如鞘膜积液或者睾丸肿瘤等情况。这种情况勃起时可能会加重，但是平时也可能会有阴囊坠胀不适或者疼痛的症状。

上述几种情况最好能到医院进行检查，需要常规进行睾丸的B超检查和医生的专科查体。先明确是生理性的情况还是疾病的情况，根据检查的结果做针对性处理。