食管憩室可无症状，当憩室逐渐增大时，综合性食物和分泌物逐渐增多，有时会自动回到口腔，有时会引起误吸，吸入还会导致肺炎、肺不张、肺脓肿等并发症，导致咳嗽、咳痰等症状。

有的会导致食道压迫、吞咽困难，病程进行性加重。有的患者还出现口臭、恶心、食欲不振等症状。个别患者因饮食困难而营养不良、体重下降，有的会引起胃肠道出血、憩室穿孔等并发症。虽然很少见，但一旦发生可能危及患者的生命。

少数食管憩室患者有可能患上癌症，因此一旦确诊为食管憩室，就需要早期积极的手术治疗。