临床上可能会引起鳞状细胞癌相关抗原偏高的原因有很多，不仅仅是见于恶性肿瘤，在一些良性疾病中也可能会升高。

鳞状细胞癌相关抗原是一种用于临床监测的肿瘤标志物，其偏高多见于鳞状细胞癌，特异性比较高。许多部位的鳞状细胞癌都可能会引起其升高，如肺癌、皮肤癌、宫颈癌、食管癌、膀胱癌等。

其常用于对鳞状细胞癌疗效、复发、转移及预后的监测。在有些良性疾病，如肺炎、肝炎等，鳞状细胞癌相关抗原也可能会增高，应注意鉴别。