肛门囊肿的治疗方法，主要就是通过抗生素药物的保守治疗，或者是通过手术进行治疗。

肛门囊肿一般是属于表皮样的囊肿，具体的发生原因，目前在临床上并不是特别清楚，也不排除和先天性的因素有一定的关联。另外，也不排除是由于肛门局部外伤等因素所引起。

肛门囊肿如果没有任何不适感觉，可以观察为主，短时间之内有快速生长，可以做切除的治疗。一般是建议完整将囊肿的包块切除，然后进行一期缝合，术后换药，促进伤口的愈合。如果肛门囊肿出现了细菌的感染，有局部的红肿疼痛的，不考虑手术治疗的，也可以使用抗生素药物进行对症的治疗。