甲状腺癌的预后与病理分型年龄手术根治程度疾病期等有关。复发和远处转移是甲状腺癌预后不良的最主要的因素。由于甲状腺癌分为4种类型。对于乳突型的甲状腺癌，大多预后良好而分化型未分化型的甲状腺癌多与确诊后一年内死亡。小于15岁和大于45岁的乳突型甲状腺癌预后较15到415岁的预后差。未分化的甲状腺癌疗效不佳，中位生存期仅3到7个月。一年和5年的生存率分别为17%和8%。高龄男性治疗前有呼吸困难的患者预后更差。