脑膜炎根据脑部感染不同的病原体，预后不同。病毒性脑膜炎通常具有自限性，治疗效果较好，治愈后不会留有后遗症。

化脓性脑膜炎和结核性脑膜炎，即使经过正规的治疗，活动期得到控制，但是因为炎性分泌物易沉积在颅底，导致蛛网膜下腔粘连，形成脑积水等后遗症。而新型隐球菌感染，通常临床效果差，易反复迁延，严重时甚至会引起死亡。

总体来说，不同病原体感染的脑膜炎，预后不同，病毒性脑炎预后最好，其他脑炎可能会留有后遗症。