囟门发育不良严重了可能会造成患儿出现整体性营养不良、热蛋白营养不良，引发皮下水肿、头颅增大，导致囟门不能正常闭合或延迟闭合。如果是钙质或维生素D缺乏引发的囟门发育不良，容易产生佝偻病，损害骨骼。

囟门发育不良的患儿应适当补充钙质以及维生素D。饮食上多给患儿补充营养，吃鸡蛋、瘦肉、猪肝等，避免孩子偏食、厌食，避免喝可乐、雪碧等酸性饮料。阳光好的时候家长带患儿多晒晒太阳，多进行户外活动。

囟门发育不良有一定的遗传因素，与孕期缺钙和营养不良也有很大关系。