孕妇做口腔CT导致畸形率不高，但也会受到一些影响，所以孕期最好不要选择有辐射的检查项目。畸形率不高原因：

1.扫描范围与腹部非常远，在头部进行扫描。

2.扫描口腔CT范围小，辐射剂量不大，受损伤以及修复就快。

3.检查时医生会把除口腔以外部分进行严密的防护，所以辐射剂量更小。

4.如果怀孕初期3个月以内受到伤害，尤其受精卵着床不稳定时，是可能会引起染色体畸形，导致胎儿畸形，所以尽量不要这时候做检查。

如果这时候受到辐射会有一定影响，但是不在这时候检查，3个月以后进行检查，胎儿基本成形，畸形率很低。