孕酮低有可能会出现肚子疼的症状。在没有怀孕的情况下，孕酮低可能会引起月经前的异常出血现象，出血时就会伴有轻微的腹痛，这种情况往往是黄体功能不足引起的。可以在排卵期以后适当补充孕激素，可以改善出血的情况，从而缓解腹痛的症状。

如果妊娠期间孕酮低，有可能会导致先兆流产，从而会出现腹痛以及阴道内流血的症状，可根据具体情况及时补充孕酮，同时注意休息，以防止流产。

但还要排除孕酮低是否是宫外孕导致的，因为宫外孕也会出现肚子疼和孕酮低的情况，宫外孕要立即终止妊娠。