在患外阴阿米巴病期间不可以做活检。在临床症状完全控制，经过实验室检查已经转为阴性的情况下，如果怀疑外阴局部有病变，可以考虑做活检。因为如果在患病期间做活检，就有可能会导致局部出现创面，这样病原菌就会经过创面而进入到血液循环，所以会造成身体的影响。

阿米巴阴道病，在临床上常常会导致局部出现相对比较严重的溃疡，有可能会怀疑是由于恶性肿瘤所导致的。只要是通过分泌物检查发现这种原虫的情况下就可以诊断，没有必要做活检。

经过治疗以后局部的症状如果完全都消失，经过实验室检查已经转为阴性。仍然可以看到局部有溃疡的现象，怀疑有恶性变，这种情况可以考虑做活检，并且送病理化验。所以，对于外阴阿米巴病，就建议积极的用甲硝唑给予治疗，绝大部分在用药后大约7到10天，症状基本上会消失，然后再做实验室检查，根据结果再决定下一步究竟应该怎么办。