腰痛跟包皮过长没有直接关系。腰痛常见的原因是重力劳作、剧烈运动等导致的腰部肌肉劳损性疼痛，也有可能是腰椎退行性病变后神经的刺激、压迫导致疼痛，不排除泌尿道结石、感染等疾病导致腰痛。

包皮过长容易积聚病菌导致龟头炎，不会直接导致腰痛症状。但是包皮过长滋生的病菌入侵尿道口，上行感染导致肾炎，这也有可能出现腰痛等相关症状。

需要辅助泌尿道彩超、腰椎拍片、尿液常规等相关检查，明确腰痛具体病因，便于针对性的治疗。