咳嗽时感觉气管疼，多见于支气管炎、肺炎等。常见的病原体为细菌、病毒等，病变部位会出现水肿、充血，所以会在咳嗽时感觉气管疼。

除此之外，这种情况也有可能与胸膜炎有关。细菌或病毒等病原体使胸膜受到刺激后，导致胸膜炎症。因此会出现咳嗽时气管疼痛的症状，一般经过消炎等对症处理后，疼痛会有所改善。

还有一些患者也有可能因肺结核，引起咳嗽时气管疼。出现这种情况，建议尽快到医院完善肺部CT、痰培养、呼吸道病原体检测等，查出致病菌之后，采取针对性治疗。