碘伏与碘酊的作用基本一样，都有消毒杀菌的功效。

但是其组方成分以及在使用方面，还是有区别。两个药物的主要成分都是碘，但是溶酶不一样，碘伏溶酶为水，碘酊溶酶为乙醇。因此，碘伏在用于皮肤伤口的消菌杀毒时，对皮肤的刺激性很小。但使用碘酊消毒皮肤伤口，会有明显的刺痛感。

而且碘伏中的碘含量，要比碘酊低一些，所以擦涂局部皮肤后不用做脱碘处理。但使用碘酊对皮肤伤口消毒后，需要脱碘处理，以避免损伤皮肤。