颌骨骨髓炎在急性期要全身应用抗生素，一般需要应用青霉素类或者头孢类抗菌药物，再联合抗厌氧菌感染的硝基咪唑类药物比如甲硝唑等。

如果局部形成脓液，就需要及时地切开引流。对于弥散性的颌骨骨髓炎患者往往会出现全身衰竭、全身中毒严重并贫血，所以除了一般支持疗法外，还可能需要少量的多次输血，以增强全身抵抗力，预防败血症。

而在颌骨骨髓炎慢性期是以死骨刮除手术以及病灶牙拔除为主。