霉菌性阴道炎主要为内源性感染，而滴虫性阴道炎感染的原因主要为性传播。

霉菌性阴道炎目前称为阴道假丝酵母菌病，主要的致病菌为白色念珠菌，可以寄居在人体的阴道、口腔和肠道内，不同部位的念珠菌可以互相传染。一旦阴道内微生态平衡被打破，则可能导致真菌过度增殖，从而发病，所以一般只需患者本人治疗即可。

而滴虫非阴道内正常寄居微生物，一旦发现阴道内有滴虫感染，必为外部感染所致。因其为性传播疾病，所以需要夫妻同治，以防互相传染。