咽拭子检测采集一般不会有特别明显的疼痛感，具体有多疼要看实际情况。

如果采集者比较熟练与专业，被采集者配合比较好，并且咽喉部位没有炎症或者其他疾病的话，可能感觉不到疼痛。但是如果由于某些原因采集的器械对采集部位造成了创面，或者咽喉部位本身就有疼痛感的症状，在采集过程中会明显感觉到疼痛的不适感，但是这种疼痛都会自行消失，不用进行治疗。

建议在采集前要了解注意事项，采集时全力配合，采集后多加护理，注意不要食用刺激性大的食物。