小孩发烧、肚子疼的原因主要包括以下两个：

第一，当小孩是由于阑尾炎而引起的发烧时，可能会伴有肚子疼的症状，此时应该通过彩超等检查，使用消炎药或者手术的方式，进行处理。

第二，若细菌或病毒等病原体感染小儿胃肠道时，小孩会出现急性的胃肠炎，也会出现发烧、肚子疼的情况。

所以应该经过详细的检查，明确具体的发病原因，然后积极地处理。需要注意的是，若体温过高，首先要进行降温处理，避免由于小儿高热，而引起的一系列严重的后果。