患上霉菌性中耳炎后，通常主要通过耳道用药及口服药物的方式进行治疗。

首先，针对中耳内的霉菌感染，可以使用水杨酸甲酯等类型的药物，滴入耳道内，可以有效地清除耳道内的霉菌，或者也可以使用制霉菌素软膏涂抹在耳道内，也可以起到同样的效果。

其次，对于霉菌性中耳炎病情较为严重的患者，或者是身体其他部位仍然存在霉菌感染的情况，通常需要口服制霉菌素片等类型的药物进行全身性的抗菌治疗。

治疗期间要定期清洗可能接触耳部的枕巾以及毛巾等日常用品，并且避免耳道进水的情况发生。