肛门脓肿破溃会引发疼痛，主要为破溃口破损所引发的疼痛，但相对于肛门脓肿本身引发的肛周疼痛比较轻微。

因为肛门脓肿本身，会导致患者肛周出现剧烈的疼痛，局部也会伴有明显的红肿。破溃后虽然会导致破溃口局部疼痛，但由于脓液流出，脓腔内的压力降低，导致肛周脓肿本身的肛周疼痛症状，反而会明显地缓解。

肛门脓肿破溃后，患者需要注意破溃口局部的护理，可以使用聚维酮碘溶液进行消毒，必要时进行局部换药。部分患者会发展成为肛瘘，可在三个月后行肛瘘手术。