药物流产的副作用主要有以下几点：

1.药流失败，由于女性某些因素导致药物效果不良引起。

2.药流不全，出现阴道的多量流血、流血持续时间长及下腹持续性疼痛，这也是最常见的副作用。

3.卵巢功能下降，出现月经量减少、甚至闭经等。

4.肝肾功能受损，药物流产是针对孕49天内的终止妊娠手段，并不适合所有女性。例如，存在内分泌系统疾病、心血管疾病、青光眼、哮喘等。

在服药之前需通过超声检查明确是宫内正常早孕状态，由于药物流产对女性的生理及心理都会造成不同程度的影响，建议没有生育要求的女性做好避孕措施。