功能性胃肠病的症状不典型，可能会出现胸骨后疼痛，而且疼痛有可能呈烧灼感。

除此以外，还可能会出现功能性的吞咽困难，有可能是会出现固体或液体食物，通过食管时感觉异常。部分患者还可能会出现餐后饱胀感，并且有可能会出现上腹部疼痛，同时可能会出现反酸嗳气以及恶心、呕吐。

如果出现肠道不适时，还可能会出现便秘以及腹泻交替出现。一旦明确该疾病的诊断，需要积极地联合使用药物治疗以及心理治疗方法，来促进疾病的恢复。