同房后小腹隐隐作痛，可能是以下原因导致：

1.同房时间过长，男性的动作太粗暴，会牵涉到小腹的肌肉发生隐痛，一般休息后很快就可以恢复。

2.炎症引起的。比如宫颈炎、子宫内膜炎，会引起小腹出现隐痛，可能伴有白带量增多、小腹坠胀、腰骶酸痛等症状。

3.子宫内膜异位症也可出现此部位隐痛，可能会伴有月经异常，还要排除是否怀孕之后先兆流产引起的隐痛。

除此之外，还考虑可能与阑尾炎有关，一般会出现右下腹隐痛。