试管婴儿第一代和第二代的最主要区别是精子和卵子的受精方式不同。第一代试管婴儿又称体外受精-胚胎移植，主要针对女性不孕不育的技术。取卵后把精子卵子放在一个培养皿中培养让其自然受精；而第二代试管婴儿又称卵泡浆内单精子显微注射主要针对的是男性不育男性精子质量差有严重的少精、弱精、畸精症，甚至无精症的患者。女方取卵后精子卵子不能自然受精，而是采取卵泡浆内单精子显微注射使其受精。这种受精方式没有经过自然选择可能会遗传男性的某些疾病。