扁桃体发炎和偏头痛有关系，一般出现扁桃体炎症有可能会诱发偏头痛，主要的原因考虑是由于自身免疫力比较低有关。

如果有存在扁桃体炎症，提示白细胞和中性粒细胞升高，可以在医师指导下应用抗生素进行抗炎治疗，在治疗的同时需要保证睡眠、注意休息、避免劳累、避免着凉，建议饮食生活要清淡，多吃点水果蔬菜，适当补充维生素。

如果头痛非常明显，也可以在医师指导下应用止痛药物改善头痛症状，但如果炎症改善，头痛症状也没有明显环境的，需要及时到二甲以上医院神经内科就诊。